Die geschichtlichen Wurzeln der SELK liegen in der Erweckungsbewegung des 19. Jahrhunderts.
Erste Gemeindebildungen erfolgten ab 1830, nach Einführung der Union, d. h. der Vereinigung von
lutherischer und reformierter Kirche in Preußen, später auch in anderen Ländern.

Aus dem Widerstand bekenntnistreuer Lutheraner gegen diese Union heraus kam es zur Bildung einer
ersten staatsfreien, bekenntnisgebundenen lutherischen Kirche auf deutschem Boden. In Hannover
und Sachsen bildeten sich später ebenfalls selbständige lutherische Gemeinden, erwachsen aus dem
Ringen um eine klare lutherische Position gegenüber dem zunehmenden Einfluss von Rationalismus
und liberaler Theologie.

1972 schlossen sich die verschiedenen unabhängigen lutherischen Kirchen zur
Selbständigen Evangelisch-Lutherischen Kirche zusammen.

Die Gemeindegründung in Lüneburg erfolgte im Jahre 1927. Schon von diesem Zeitpunkt an nutzte
die Gemeinde die Kirche am Springintgut 6a für ihre Gottesdienste. 1956 konnte die Kirche gekauft werden.
Das Gemeindehaus mit der Küsterwohnung wurde 1987 eingeweiht. Heute hat die Gemeinde ca. 200 Glieder.